Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm14089-201ENSMUST00000130025 318 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm6706-201ENSMUST00000145087 318 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Glyatl3-201ENSMUST00000166343 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm20319-201ENSMUST00000172522 771 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm10637-201ENSMUST00000183718 828 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm29068-201ENSMUST00000191607 400 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Sp3-201ENSMUST00000066003 3808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gpatch2l-201ENSMUST00000071106 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Duxbl1-203ENSMUST00000172667 2209 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Cd200-201ENSMUST00000023341 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ikbkap-201ENSMUST00000030140 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Lrrc43Q3V0L5 Serpinb6a-202ENSMUST00000043552 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ect2l-205ENSMUST00000209178 2586 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Lrrc43Q3V0L5 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Lrrc43Q3V0L5 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Lrrc43Q3V0L5 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Lrrc43Q3V0L5 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm1943-201ENSMUST00000211890 174 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 CT010465.1-202ENSMUST00000221816 1355 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rbm43-206ENSMUST00000165313 1975 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Zcchc12-203ENSMUST00000115257 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Strn-201ENSMUST00000024881 2967 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Cdk16-202ENSMUST00000115364 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Gm44503-201ENSMUST00000149692 4383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc80-201ENSMUST00000061050 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Ncaph2-201ENSMUST00000036987 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Plp1-202ENSMUST00000113085 2540 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Rpp14-201ENSMUST00000023924 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef38-203ENSMUST00000161022 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Dpp6-202ENSMUST00000101471 4491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Lrrc43Q3V0L5 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms