Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 4933407I05Rik-203ENSMUST00000214646 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhga7-202ENSMUST00000193476 3044 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gtpbp6Q3U6U5 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Gtpbp6Q3U6U5 Ddx24-206ENSMUST00000221211 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gtpbp6Q3U6U5 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gtpbp6Q3U6U5 Cpm-201ENSMUST00000020399 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gtpbp6Q3U6U5 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2d22-201ENSMUST00000023083 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Lilr4b-201ENSMUST00000102894 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Nedd4l-201ENSMUST00000080418 3326 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Ddx47-201ENSMUST00000032326 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Top3a-202ENSMUST00000102668 3542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr85-202ENSMUST00000115491 2165 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gtpbp6Q3U6U5 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms