Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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Q3U6N9 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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Q3U6N9 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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Q3U6N9 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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Q3U6N9 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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Q3U6N9 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Q3U6N9 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Q3U6N9 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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Q3U6N9 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Q3U6N9 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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Q3U6N9 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Q3U6N9 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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