Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Grin2bQ01097 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Rbm12-202ENSMUST00000109604 6635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Grin2bQ01097 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms