Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 4930480G23Rik-201ENSMUST00000125909 1013 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 AC154806.5-204ENSMUST00000228900 867 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprkP35822 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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