Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxc11P31313 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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