Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
RxraP28700 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RxraP28700 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RxraP28700 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
RxraP28700 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RxraP28700 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RxraP28700 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RxraP28700 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RxraP28700 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RxraP28700 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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