Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Tfcp2l1-201ENSMUST00000027629 9269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Arhgap4-205ENSMUST00000114407 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr237-ps1-202ENSMUST00000215911 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm2136-201ENSMUST00000193945 2577 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Ms4a6d-201ENSMUST00000025582 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Igkv12-89-201ENSMUST00000103335 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm10651-201ENSMUST00000118212 609 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm12925-201ENSMUST00000130791 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Sfta2-202ENSMUST00000174521 649 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm30270-201ENSMUST00000202675 524 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Vmn2r-ps91-201ENSMUST00000213039 784 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm34304-201ENSMUST00000218927 1139 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC162934.2-201ENSMUST00000221451 249 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm45629-201ENSMUST00000209629 2546 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm9936-201ENSMUST00000201635 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Grhl3-201ENSMUST00000105855 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Zfp82-207ENSMUST00000183190 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm26719-201ENSMUST00000180395 3220 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr654-203ENSMUST00000213984 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr1347-202ENSMUST00000207339 1737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Nrxn3-202ENSMUST00000110130 3654 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Ptger2-201ENSMUST00000046891 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr324-202ENSMUST00000214990 3624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm44641-201ENSMUST00000152342 323 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prim1P20664 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms