Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
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Ccl20O89093 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
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Ccl20O89093 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Ccl20O89093 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ccl20O89093 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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