Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp35M0QWN7 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp35M0QWN7 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms