Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Nip7-201ENSMUST00000034392 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Pramef17-201ENSMUST00000105762 1753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm45821-201ENSMUST00000211967 1757 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Ednra-201ENSMUST00000034029 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm38242-201ENSMUST00000192354 430 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Ms4a6d-201ENSMUST00000025582 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Btbd16-201ENSMUST00000048453 3434 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm2098-201ENSMUST00000189146 1763 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm20388-201ENSMUST00000127664 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Ptbp3-210ENSMUST00000173699 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 A830036E02Rik-204ENSMUST00000139095 3413 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Gm2056J3QQ02 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms