Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm37949-201ENSMUST00000192808 2091 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Wdr48-208ENSMUST00000217472 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Nme8-201ENSMUST00000039340 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm37829-201ENSMUST00000193864 2213 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp9yF8VPU6 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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