Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3550W4VSN7 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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