Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms