Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Col5a3Q9JLI2 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Col5a3Q9JLI2 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Col5a3Q9JLI2 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Nmnat2-201ENSMUST00000043313 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Col5a3Q9JLI2 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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