Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 D330037F02Rik-202ENSMUST00000217400 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr977-ps1-201ENSMUST00000217438 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm10260-201ENSMUST00000074072 561 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm10024-201ENSMUST00000075421 553 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Snora65-201ENSMUST00000083190 130 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Cdh26-201ENSMUST00000042092 2891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Rnf141-209ENSMUST00000177236 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Ceacam1-202ENSMUST00000098668 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr704-201ENSMUST00000080925 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm45821-201ENSMUST00000211967 1757 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm26209-201ENSMUST00000103852 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 n-R5s90-201ENSMUST00000103968 118 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Rpl23a-ps3-201ENSMUST00000104925 468 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm14648-201ENSMUST00000119328 483 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr621-ps1-201ENSMUST00000119741 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Rpl21-ps15-201ENSMUST00000121545 483 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm12163-201ENSMUST00000121597 389 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Kcnab3os-201ENSMUST00000136196 566 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Trim39Q9ESN2 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Kmt5a-212ENSMUST00000198451 1032 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm23927-202ENSMUST00000199928 216 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm32921-201ENSMUST00000200592 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm34611-201ENSMUST00000223252 627 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Fgfbp1-201ENSMUST00000061299 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Rpl21-ps7-201ENSMUST00000077420 483 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm26244-201ENSMUST00000083435 164 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm10335-201ENSMUST00000096020 468 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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