Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
OtofQ9ESF1 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
OtofQ9ESF1 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms