Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nup155Q99P88 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nup155Q99P88 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Nup155Q99P88 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Nup155Q99P88 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Nup155Q99P88 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Nup155Q99P88 Lsamp-202ENSMUST00000099761 8794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Nup155Q99P88 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Nup155Q99P88 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Nup155Q99P88 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Nup155Q99P88 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Nup155Q99P88 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms