Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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Atg16l1Q8C0J2 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Atg16l1Q8C0J2 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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Atg16l1Q8C0J2 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Atg16l1Q8C0J2 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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Atg16l1Q8C0J2 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Atg16l1Q8C0J2 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Atg16l1Q8C0J2 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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