Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms