Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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Htatsf1Q8BGC0 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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Htatsf1Q8BGC0 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
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Htatsf1Q8BGC0 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Htatsf1Q8BGC0 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
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Htatsf1Q8BGC0 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
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Htatsf1Q8BGC0 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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Htatsf1Q8BGC0 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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Htatsf1Q8BGC0 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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Htatsf1Q8BGC0 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Htatsf1Q8BGC0 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Htatsf1Q8BGC0 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Htatsf1Q8BGC0 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Htatsf1Q8BGC0 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
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