Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
ChfrQ810L3 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms