Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Slc13a1-201ENSMUST00000031713 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa7-201ENSMUST00000048249 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.8 ms