Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Actn1Q7TPR4 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms