Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
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Ccdc88cQ6VGS5 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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