Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Cacnb2-214ENSMUST00000193800 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Mei1-203ENSMUST00000188048 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm45821-201ENSMUST00000211967 1757 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm5316-202ENSMUST00000185734 3096 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm38242-201ENSMUST00000192354 430 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Zfp791-201ENSMUST00000098550 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Ulk4-201ENSMUST00000051479 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Clcn1Q64347 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms