Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp39Q3TIX9 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp39Q3TIX9 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp39Q3TIX9 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp39Q3TIX9 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp39Q3TIX9 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Usp39Q3TIX9 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Usp39Q3TIX9 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Usp39Q3TIX9 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
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