Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Rpusd3Q14AI6 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
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Rpusd3Q14AI6 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Rpusd3Q14AI6 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms