Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms