Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm15127-202ENSMUST00000101190 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm37978-201ENSMUST00000194736 2915 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Arhgef9-210ENSMUST00000182001 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TrioQ0KL02 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms