Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Serpina3f-203ENSMUST00000167049 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Cyp1a1-202ENSMUST00000216433 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Ccdc77-201ENSMUST00000032283 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccl21cP86793 Olfr523-205ENSMUST00000215785 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms