Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 4930562A09Rik-201ENSMUST00000153818 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 1700009C05Rik-201ENSMUST00000191101 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm26705-201ENSMUST00000180761 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Irx2P81066 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm8817-201ENSMUST00000126769 693 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 1110059E24Rik-202ENSMUST00000177577 599 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Rps11-204ENSMUST00000211725 493 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Rpl7a-ps8-201ENSMUST00000094754 801 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Irx2P81066 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Irx2P81066 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms