Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rps29P62274 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms