Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NcstnP57716 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
NcstnP57716 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcstnP57716 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcstnP57716 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcstnP57716 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NcstnP57716 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms