Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RxraP28700 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
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