Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RhoP15409 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
RhoP15409 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
RhoP15409 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RhoP15409 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RhoP15409 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RhoP15409 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RhoP15409 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RhoP15409 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RhoP15409 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RhoP15409 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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