Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Vpreb2P13373 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms