Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Ighv1-55-201ENSMUST00000103526 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Phyhd1-203ENSMUST00000113643 1195 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm6505-201ENSMUST00000094335 648 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Rpl7a-ps8-201ENSMUST00000094754 801 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 1110019D14Rik-202ENSMUST00000181225 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm23827-201ENSMUST00000157116 145 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Smim18J3QNP2 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms