Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Slc43a2-211ENSMUST00000169547 7145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usf3B2RUQ2 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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