Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PtprbB2RU80 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms