Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Mrpl40Q9Z2Q5 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms