Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Gm25837-201ENSMUST00000158919 108 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Tmem241-203ENSMUST00000092075 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
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