Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Col5a3Q9JLI2 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 763.5 ms