Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms