Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm2694-209ENSMUST00000210935 1125 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 C1ra-201ENSMUST00000068593 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Sfi1-201ENSMUST00000066391 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm43827-201ENSMUST00000200623 1390 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr1491-204ENSMUST00000216366 1726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Brd9-206ENSMUST00000222399 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Zbtb37-201ENSMUST00000159250 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Ccnt1-201ENSMUST00000012104 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Cnga3-201ENSMUST00000027288 3554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Foxp3-203ENSMUST00000115739 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Ttc39c-204ENSMUST00000169401 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm3252-202ENSMUST00000178748 450 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm11567-201ENSMUST00000078442 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Olfr551-201ENSMUST00000098224 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Vps8-204ENSMUST00000117598 4935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm11239-201ENSMUST00000171348 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm11237-201ENSMUST00000178319 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm11236-201ENSMUST00000180092 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm428-201ENSMUST00000084475 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Gm11238-201ENSMUST00000084479 1323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 March1-206ENSMUST00000110256 3288 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Art4-201ENSMUST00000032341 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Riok3Q9DBU3 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms