Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc71Q8VEG0 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc71Q8VEG0 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc71Q8VEG0 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc71Q8VEG0 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc71Q8VEG0 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc71Q8VEG0 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc71Q8VEG0 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Ccdc71Q8VEG0 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ccdc71Q8VEG0 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ccdc71Q8VEG0 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ccdc71Q8VEG0 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Ccdc71Q8VEG0 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc71Q8VEG0 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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