Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Nhlrc3Q8CCH2 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms