Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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FarsaQ8C0C7 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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FarsaQ8C0C7 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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FarsaQ8C0C7 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FarsaQ8C0C7 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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