Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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Cldn17Q8BXA6 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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Cldn17Q8BXA6 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Cldn17Q8BXA6 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Cldn17Q8BXA6 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Cldn17Q8BXA6 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Cldn17Q8BXA6 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cldn17Q8BXA6 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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Cldn17Q8BXA6 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cldn17Q8BXA6 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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