Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm18980-201ENSMUST00000199098 1079 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
NipblQ6KCD5 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms